Tím New England Whalers vznikol v novembri 1971, kedy WHA ocenila organizáciou miestnych podnikateľov Howarda Baldwina, Johna Coburna, Godfreyho Wooda a Williama E. Barnesa.
Whalers začali hrať v Bostone, v ktorom hrával aj tím NHL Boston Bruins. Práve bývalý obranca Bruins Ted Green sa stal prvým kapitánom tímu, ktorý podpísal zmluvy s nezvyčajne veľkým množstvom amerických hráčov.
Klubu sa pred premiérovou sezónou podarilo získať aj ďalšie hviezdy z NHL – brankára Ala Smitha, útočníka Toma Webstera a obrancov Ricka Leyho, Jima Doreya a Brada Selwooda. Klub viedol legendárny tréner Jack Kelley a v úvodnej sezóne sa tímu naozaj darilo. Whalers zaznamenali najlepšiu bilanciu po základnej časti a podarilo sa im získať aj Avco World Trophy.
Počas prvého dva a pol roku existencie hrávali Whalers svoje domáce zápasy v bostonských halách Boston Arena a Boston Garden, a v hale The Big E Coliseum, ktorá sa nachádzala v Západnom Springfielde. Návštevnosť klesala a tak sa majitelia rozhodli sťahovať tím do Connecticutu.
Klub našiel svoje nové sídlo v Hartforde, kde 11. januára 1975 odohral prvý zápas pred vypredaným hľadiskom haly Hartford Civic Center Coliseum. V tejto aréne hrávali Whalers pravidelne až do roku 1997, kedy sa klub presťahoval do Severnej Karolíny. Jedinú prestávku predstavovalo obdobie na konci 70. rokov, kedy sa hala rekonštruovala. Klub vtedy hrával v Springfield Civic Center.
Aj napriek tomu, že New England už nedokázal zopakovať triumf z úvodnej sezóny, vždy patril k úspešným tímom a nikdy v histórii WHA nevynechal play-off. Mal jednu z najstabilnejších zostáv v lige a v roku 1977 ho posilnil aj slávny Gordie Howe, vďaka ktorému sa v roku 1978 Whalers opäť prebojovali do finále.
New England Whalers bol jedným z štyroch tímov WHA, ktorý prežili zánik ligy a od roku 1979 sa stali členmi NHL. Na základe žiadosti tímu Boston Bruins sa Whalers museli vzdať „New England“ v názve svojho tímu a tak klub do NHL vstúpil pod názvom Hartford Whalers.
Klub vo WHA odohral celkovo 555 zápasov, z ktorých 281 vyhral a v 38 prípadoch remizoval. Najviac zápasov odohral za tím Rick Ley (478), ktorý nazbieral aj najviac trestných minút (716). Najproduktívnejším hráčom histórie organizácie z čias WHA(1972-1979) bol Tom Webster s 425 bodmi, ktorý nastrieľal aj najviac gólov (220).